Miten ymmärtää virtaussytometriatulokset

Miten ymmärtää virtaussytometriatulokset Polka Dot RF / Polka Dot / Getty Images

Tutkijat käyttävät virtaussytometriaa erotella eri solujen tai mikroskooppiset eliöt.Se on väline, jota käytetään monissa sovelluksissa, kuten lääketieteellisen diagnostiikan tai Oikeuslääketiede.Vaikka tämä kokeellinen tekniikka on melko helppo toteuttaa, analyysin kompleksin tuottaman tiedon virtaussytometrillä on vaikeaa, koska useita kokeellisia tekijöitä ja / tai sytometrillä parametreja.Sellaisena se on rutiinia sytometrinen tietojen visualisoida ja analysoida käyttämällä kehittyneitä ammatilliset ohjelmat kuten CellQuest tai FlowJo.Perehtyneisyys virtaussytometrillä tekniikoita, koneet ja ohjelmistot on tarpeen ymmärtää tuottamat tulokset näistä kokeista.

mitä tarvitset

  • FlowJo tai muita virtaussytometria tietojen analysointi ohjelmisto
  • raaka tietoja virtaussytometrit
  • Virtaussytometriaa kokeellisia protokollia ja koneasetukset

ymmärtäminen Virtaussytometria Data

  • Selvitä Kokeilun tarkoituksena kysymällä, "Mikä oli kys

    ymys tai hypoteesi tutkitaan?"Tämä tarvitaan säätää raaka tulokset soveltuvassa muodossa ja asetukset tarkempaa analysointia tilastollisin sytometriaa ohjelmistoa.Tee mitä muutoksia tarvitaan, jotta tiedot näkyvät kanssa tarvittavat asetukset (esim positiivisia soluja, negatiivinen portit, fluoresenssivoimakkuus, solupopulaatioita jne).

  • Etsi portit.Solut voidaan ryhmitellä tai ainoastaan ​​todenneet aihekokonaisuuksien yhdessä tiheys tontti tai ääriviivat kaavio.Ryhmät usein erillään riippuen heidän henkilöllisyytensä.Jos yksi ryhmä tahroja hyvin intensiivisesti tietyn merkki tai vasta, voidaan päätellä, että kyseisen ryhmän kaikilla on identiteetin erityisten solu- tyyppiä, joka ilmaisee, että merkki.On tavallista, että solut, jotka ovat positiivisia useamman kuin yhden näiden markkereiden, ja nämä solut ovat yleensä väli- ja merkittynä "double-positiivinen."

  • Katsokaa scattergraphs.Tapa soluryhmistä levittäytyvät parvikuvio on osoitus solujen koon.Solut erittäin suuri tai suuri siroaa ovat tyypillisesti suuria soluja;mutta ne voivat olla suuria, koska ne sisältävät suuren osuuden sytoplasmasta, tai ne voivat olla korkea, koska niillä on hyvin suuri ydin.Riippuen biologian tutkitaan, tämä on tietenkin, vaihtelevat suuresti kokeiden välillä.

  • Katso numeroita.Säädä tontteja näyttämään eri parametrien yhdellä akselilla (yleensä X-akseli) pitäen luottaa Y-akselilla.Tämä osoittaa otoksen suhteeseen väestöstä, jotka ovat positiivisia kyseisen parametrin, kuten huippu normaalisti havaitaan positiivisesti-värjätty näyte, joka on poissa negatiivinen kontrollinäytteestä.

  • Katsokaa usean parametrin histogrammit.Säätämällä X-akselin ja Y-akselin edustavat kukin eri parametri, tutkittiin kokeen aikana, on mahdollista saada syvemmän ymmärryksen näytteen ominaisuuksista.Esimerkiksi asettamalla X-akselin punainen fluoresenssi ja Y-akselin vihreän fluoresenssin, kvadrantin tyyli portit voidaan laskea näytteen näyttää neljällä alueella neljänneksessä, jossa solut ovat läsnä ja värjättiin joko punainen tai vihreäfluoresenssi, molemmat värit, tai ei ollenkaan.Tämä mahdollistaa heterogeeninen näyte jaetaan sen komponenttien päällekkäisyyksien yhteisöistä voidaan visualisoida sekä määrällisesti.

494
0
1
College