Kuidas mõista Voolutsütomeetriline tulemused

Kuidas mõista Voolutsütomeetriline tulemused Polka Dot RF / Polka Dot / Getty Images

teadlased kasutavad voolutsütomeetriat eristada erinevat tüüpi rakke või mikroskoopilised organismid.See on vahend, mida kasutatakse paljudes rakendustes, nagu meditsiinilises diagnostikas või kohtuekspertiisi patoloogia.Kuigi see eksperiment on üsna lihtne täita, analüüsi kompleksi poolt toodetavate andmete vooltsütomeetril on raskem tõttu mitu eksperimentaalse tegurid ja / või cytometer parameetreid.Sellisena on rutiinne tsütofluorimeetrilise andmete visualiseerimist ja analüüsiti kasutades keerukamaid professionaalse programmidega nagu CELLQuest või FlowJo.Tundmine läbivoolutsütomeetriaga tehnikaid, masinad ja tarkvara on vajalik selleks, et mõista, mis on saavutatud neid eksperimente.

, mida te vajate

  • FlowJo või muu läbivoolutsütomeetriaga andmeanalüüsi tarkvara
  • algandmed voolutsütomeetrid
  • Vooltsütomeetria katseprotokollidega ja masinseaded

mõistmine Voolutsütomeetriline Andmed

  • Selgitada katse eesmärki, küsides: "Mis ol

    i küsimus või hüpoteesi uuritakse?"See on vaja reguleerida raw tulemused sobiva formaadi ja seaded edasiseks analüüsiks kasutades statistilisi tsütomeetria tarkvara.Tee milliseid muudatusi on vaja selleks, et olla kuvatud andmed asjaomaste sätete (nt positiivsed rakud, negatiivne väravad, fluorestsentsi intensiivsus, rakupopulatsioonidel jne).

  • Leia väravad.Rakke saab grupeerida või lihtsalt täheldatud rühmitatud koos tihedus krundi või kontuuri diagramm.Rühmad sageli eraldi sõltuvalt nende identiteeti.Kui üks rühm plekke väga intensiivselt teatud marker või antikeha, järeldatakse, et selle rühma liikmetel on kõigil identiteedi konkreetse raku tüübist, mis väljendab seda markerit.On tavaline, et leida rakud, mis annavad positiivseid kauem kui üks nende markerite ning need rakud on tavaliselt vahe- ja tähistatakse "double-positiivne."

  • Vaata scattergraphs.Tee rühmad rakkude laiali hajuvusdiagrammile on märge suurus rakke.Rakke väga suurte või väga kõrge hajutab tavaliselt suured rakud;Kuid nad võivad olla suured lihtsalt kuna need sisaldavad suurel osal tsütoplasmas, või nad võivad olla kõrge, sest neil on väga suur tuuma.Sõltuvalt bioloogia uuritakse, see on muidugi väga erinevad eksperimendid.

  • Vaata numbrid.Reguleerige krundid näidata erinevaid parameetreid ühel teljel (tavaliselt X-telg), hoides loodab, et Y-teljel.See näitab, kui suur osa proovi elanikkonnast, mis on positiivsed selle konkreetse parameetri, kui tipp tavaliselt täheldatakse Positiivselt värviti proovi, mis kestab puududa negatiivse kontrollproovi.

  • Vaata mitu parameetrit histogrammid.Muutes X-telje ja Y-telge, et kumbki teist parameetrit, mis uuriti Eksperimendi ajal on võimalik saada sügavamat arusaamist proovi omadustest.Näiteks seades X-telje punane fluorestsents ja Y-telje roheline fluorestsents, mõõturit stiilis väravad saab arvutada proovi näidata neli piirkonda mõõturit, kus rakud on olemas ja värvida kas punane või rohelinefluorestsentsi, nii värvi, või üldse mitte.See võimaldab heterogeenne proovi jagada koostisosadeks ja kattuvate üksuste visualiseerida samuti mõõta.

626
0
1
Kolledž